Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms