Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR5

Tcf23, Transcription factor 23, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf23Q9JLR5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tcf23Q9JLR5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcf23Q9JLR5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf23Q9JLR5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf23Q9JLR5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf23Q9JLR5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf23Q9JLR5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf23Q9JLR5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf23Q9JLR5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf23Q9JLR5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf23Q9JLR5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms