Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap29Q9ERB0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms