Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc3Q9D6Y1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc3Q9D6Y1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms