Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx20Q9D2Y5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx20Q9D2Y5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms