Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan11Q9D1D1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan11Q9D1D1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms