Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znhit3Q9CQK1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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