Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d23Q8K0F1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d23Q8K0F1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d23Q8K0F1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms