Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lancl3Q8CD19 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms