Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
6820408C15RikQ8BJX2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.31■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.31■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6820408C15RikQ8BJX2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
6820408C15RikQ8BJX2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms