Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Npm2Q80W85 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Npm2Q80W85 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Npm2Q80W85 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms