Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zbtb40Q6PCS8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbtb40Q6PCS8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbtb40Q6PCS8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms