Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx11Q6AXC6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx11Q6AXC6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx11Q6AXC6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx11Q6AXC6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ddx11Q6AXC6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx11Q6AXC6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms