Protein–RNA interactions for Protein: Q6A098

Secisbp2l, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2lQ6A098 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Secisbp2lQ6A098 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Secisbp2lQ6A098 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Secisbp2lQ6A098 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Secisbp2lQ6A098 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Secisbp2lQ6A098 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2lQ6A098 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2lQ6A098 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2lQ6A098 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2lQ6A098 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2lQ6A098 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2lQ6A098 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2lQ6A098 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2lQ6A098 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2lQ6A098 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms