Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
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Clcn1Q64347 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clcn1Q64347 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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Clcn1Q64347 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcn1Q64347 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcn1Q64347 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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Clcn1Q64347 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcn1Q64347 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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Clcn1Q64347 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcn1Q64347 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcn1Q64347 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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Clcn1Q64347 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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Clcn1Q64347 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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Clcn1Q64347 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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Clcn1Q64347 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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Clcn1Q64347 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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Clcn1Q64347 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcn1Q64347 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms