Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mre11Q61216 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms