Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3Q60803 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms