Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc27a1Q60714 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a1Q60714 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms