Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prkaa1Q5EG47 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prkaa1Q5EG47 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms