Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu2Q3U308 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctu2Q3U308 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms