Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd11Q1RNF8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd11Q1RNF8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms