Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd13P70217 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd13P70217 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd13P70217 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms