Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Samsn1P57725 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samsn1P57725 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samsn1P57725 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms