Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CnbpP53996 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CnbpP53996 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms