Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fgd1P52734 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fgd1P52734 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgd1P52734 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms