Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa11P50709 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa11P50709 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa11P50709 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa11P50709 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms