Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr1P30548 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms