Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf239P24399 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Znf239P24399 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Znf239P24399 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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