Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb5P09079 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb5P09079 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms