Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01725 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01725 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01725 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01725 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01725 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01725 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01725 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01725 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01725 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01725 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01725 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01725 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01725 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01725 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01725 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01725 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01725 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01725 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01725 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01725 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01725 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01725 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01725 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01725 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01725 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01725 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01725 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01725 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01725 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01725 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01725 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01725 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01725 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01725 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01725 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01725 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01725 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01725 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01725 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01725 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01725 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01725 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01725 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01725 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01725 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01725 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01725 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01725 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01725 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01725 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01725 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01725 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01725 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01725 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01725 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms