Protein–RNA interactions for Protein: O88737

Bsn, Protein bassoon, mousemouse

Predictions only

Length 3,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsnO88737 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BsnO88737 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BsnO88737 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BsnO88737 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BsnO88737 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BsnO88737 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BsnO88737 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BsnO88737 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BsnO88737 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BsnO88737 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BsnO88737 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BsnO88737 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BsnO88737 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BsnO88737 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BsnO88737 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BsnO88737 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BsnO88737 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BsnO88737 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BsnO88737 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BsnO88737 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BsnO88737 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BsnO88737 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BsnO88737 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BsnO88737 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BsnO88737 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BsnO88737 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BsnO88737 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsnO88737 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsnO88737 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsnO88737 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsnO88737 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsnO88737 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsnO88737 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsnO88737 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsnO88737 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsnO88737 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsnO88737 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BsnO88737 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsnO88737 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsnO88737 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BsnO88737 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsnO88737 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsnO88737 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BsnO88737 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsnO88737 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsnO88737 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsnO88737 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsnO88737 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsnO88737 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsnO88737 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BsnO88737 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsnO88737 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsnO88737 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsnO88737 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsnO88737 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsnO88737 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BsnO88737 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsnO88737 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsnO88737 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsnO88737 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsnO88737 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BsnO88737 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BsnO88737 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsnO88737 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsnO88737 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsnO88737 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsnO88737 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsnO88737 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BsnO88737 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsnO88737 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BsnO88737 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms