Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vamp4O70480 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms