Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
StrnO55106 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
StrnO55106 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
StrnO55106 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
StrnO55106 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
StrnO55106 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
StrnO55106 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
StrnO55106 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
StrnO55106 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
StrnO55106 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
StrnO55106 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
StrnO55106 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
StrnO55106 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
StrnO55106 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
StrnO55106 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
StrnO55106 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
StrnO55106 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
StrnO55106 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
StrnO55106 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
StrnO55106 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
StrnO55106 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
StrnO55106 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
StrnO55106 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
StrnO55106 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
StrnO55106 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
StrnO55106 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
StrnO55106 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
StrnO55106 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
StrnO55106 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
StrnO55106 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
StrnO55106 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
StrnO55106 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
StrnO55106 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
StrnO55106 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
StrnO55106 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
StrnO55106 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
StrnO55106 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
StrnO55106 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
StrnO55106 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
StrnO55106 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
StrnO55106 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
StrnO55106 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
StrnO55106 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
StrnO55106 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
StrnO55106 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StrnO55106 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StrnO55106 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StrnO55106 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
StrnO55106 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
StrnO55106 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StrnO55106 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StrnO55106 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StrnO55106 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StrnO55106 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StrnO55106 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
StrnO55106 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
StrnO55106 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
StrnO55106 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StrnO55106 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
StrnO55106 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
StrnO55106 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
StrnO55106 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StrnO55106 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StrnO55106 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
StrnO55106 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
StrnO55106 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StrnO55106 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StrnO55106 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StrnO55106 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
StrnO55106 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StrnO55106 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StrnO55106 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StrnO55106 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
StrnO55106 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StrnO55106 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StrnO55106 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
StrnO55106 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StrnO55106 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
StrnO55106 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StrnO55106 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StrnO55106 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StrnO55106 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
StrnO55106 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StrnO55106 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
StrnO55106 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
StrnO55106 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms