Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Flot1O08917 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Flot1O08917 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Flot1O08917 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Flot1O08917 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Flot1O08917 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Flot1O08917 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Flot1O08917 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Flot1O08917 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Flot1O08917 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Flot1O08917 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Flot1O08917 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Flot1O08917 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Flot1O08917 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Flot1O08917 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Flot1O08917 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Flot1O08917 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms