Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r194J3JS27 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms