Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brpf1B2RRD7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms