Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn7aB1AYL1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms