Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4bB1AWC9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4bB1AWC9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms