Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ino80eA0A0U1RP99 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ino80eA0A0U1RP99 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms