Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms