Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Knop1Q9Z2Q2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.2 ms