Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms