Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk1eQ9JMK2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms