Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfcp2Q9ERA0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms