Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx6Q9ER75 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx6Q9ER75 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms