Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms