Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms