Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap5s1Q9D742 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms