Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt34Q9D646 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt34Q9D646 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt34Q9D646 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt34Q9D646 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt34Q9D646 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt34Q9D646 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt34Q9D646 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt34Q9D646 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt34Q9D646 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt34Q9D646 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt34Q9D646 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms