Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc8Q9CYA6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms